Bệnh viện Đại học Tokyo được khánh thành ở Edo (Tokyo ngày nay), vào năm 1858, với khởi thủy là Trung tâm tiêm phòng Kanda Otamagaike. Từ những năm đi vào cho đến ngày hôm nay, *sau hơn 150 năm, bệnh viện vẫn là động lực cho cả ngành y học và chăm sóc y tế tại Nhật Bản.*
Bệnh viện Đại học Tokyo có quy mô 1,210 giường bệnh (bao gồm 1,150 giường thường, 60 giường bệnh tâm thần) và 3,888 công nhân viên (gồm 2,554 nhân viên toàn thời gian và 1,334 nhân viên bán thời gian). Chỉ trong năm 2010, bệnh viện đã tiếp nhận 389,830 bệnh nhân nội trú (trung bình 1,074 bệnh nhân/ngày) và 794,454 bệnh nhân ngoại trú (trung bình 3,079 bệnh nhân/ ngày) và thực hiện tới 10,752 ca phẫu thuật. Dựa trên những số liệu thường niên này, có thể khẳng định rằng bệnh viện Đại học Tokyo là một trong những bệnh viện lớn hàng đầu tại Nhật Bản. *Bệnh viện cũng được công nhận là 1 trong 10 bệnh viện lớn và tốt nhất thế giới* bởi tạp chí Newsweek 2019